Como sabemos anteriormente, en el ultimo Splatfest, Callie perdio contra Marie, dejando a Marie como la mejor Squid Sister. En este modo historia, Marie buscara tú ayuda (Que se ve en Splatoon 2, en una pequeña zona, parada con su paraguas mirandote cerca de donde esta la entrada a Salmon Run) para derrotar a las malvadas octarianas y rescatar a Callie de los tentaculos de Dj Octavio y regresarla a casa.

En el modo historia se presentan los tipicos obstaculos y personajes.

Las Off the Hook son las nuevas estrellas pop de Splatoon como reemplazo de Callie y Marie. Tienen su misma función, hacer conciertos en Inkopolis y Splatfests, además de también ser las agentes 6 y 7 en Octo Expansion.

Sus nombres son Perla (Una Inkling rapera) y Marina (Una Octariana Dj' buena), no se sabe mucho la historia de Marina y del porque es diferente a las demás octolings, ya que se encarna una gran diferencia. Sus canciones que hicieron son: Acid Hues, Ebb and Flow, Muck Warfare y Color Pulse. Y para Octo Expansion hicieron Nasty Majesty, Shark Bytes, Fly Octo Fly (Mejor dicho, el remix de Ebb and Flow) e para cerrar el modo historia Into the Light.

Muchisima gente prefiere a las Squid Sisters, pero creo que Las Off the Hook las pisaron con sus nuevos hits.

Octo Expansion (Expansion Octariana) es el nuevo y reciente modo historia de Splatoon, en el que se tratará de que tomaremos el papel de una/un Octoling en el que son por asi decirlos 'experimentos' por los que se escapan y terminan en el metro inconcientes, donde se encontraran al Capitan Cuttlefish, de la primera entrega de Splatoon, ya que se extravio (desaparecio) el Agente 3. Perla y Marina también estarán ayudandote.

Cuenta con mini tests en los que podrán usar movimientos especiales, armas o nada. Acompañado de niveles especiales para los Octarianos, pero...¿Modificados? No se sabe que les paso. Si terminas Octo Expansion y todos los retos, tendrás el acceso a poder ser un Octoling jugable.

¿Quien no conoce los coloridos Inklings? Calamares humanoides amantes de la lucha que pueden volver a su forma en cualquier momento y al morir se regeneran gracias a su alma, con colores unicos en los que pueden nadar en tinta (de su color, ya que si nadan en otra se autolastiman) y disparar este liquido de color gracias a sus armas como baldes, rodillos gigantes, pistolas, nerfers pinceles enormes e incluso un paraguas lanza-tinta. Además de disparar tinta, pueden hacer supersaltos y ataques especiales.

Los inkling, son muy fanaticos de estar a la moda, con sombreros, lentes, zapatos y abrigos. Además de esto, pueden aumentar sus habilidades como deslizamiento en la tinta, velocidad o atrazarse en cargar sus frascos de tinta con mejoras.

Octolings

No todo es felicidad y color para los inklings, tienen sus contrapartes, los Octolings u Octarianos. Pulpos con las mismas capacidades de los inkling pero en vez de muchos colores, usan turquesa u negro.

Salmon Run es un modo multijugador cooperativo en Splatoon 2 para hasta cuatro jugadores. Cada partida de Salmon Run consiste en tres ofensivas; para completarlas, los jugadores deben recoger alevines dorados y huevos rojos derrotando a los Salmónidos y depositándolos en la nasa pesquera. Cada Gran Salmónido derrotado suelta tres alevines dorados; si no son recogidos en el tiempo establecido, un rastrerón aparecerá y se los llevará. Cada jugador puede llevar solo un alevín dorado a la vez.

Cada ofensiva tiene un cupo, el cual varía en el número de jugadores presentes. Si la cuota no se cumple antes de que el contador llegue a cero o si todos los jugadores son eliminados, la partida terminará en fracaso.

Completar una partida aumentará la tasa de valoración del jugador, la cual también determina la dificultad de las rondas. Si son derrotados, los jugadores seguirán siendo pagados por los alevines dorados que recogieron, pero su tasa de valoración podría bajar.

Los Inklings en este modo están equipados con ropa especial que les permite ser revividos si son eliminados. Si lo son, un salvavidas aparecerá en su última posición. Pintándolo, un compañero puede salvarlo junto a un pequeño periodo de invulnerabilidad. Si consiguen un alevín dorado antes de ser eliminado, no se perderá y podrán depositarlo solo después de ser revividos.

A cada jugador se le entrega un arma diferente para cada ronda, y dos usos de un arma especial para las tres rondas. Estas pueden ser el Rayo tintódico, el Propulsor, el Salto explosivo y la Ráfaga explosiva.